Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFEP18615 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFEP18615 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFEP18615 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFEP18615 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFEP18615 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFEP18615 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFEP18615 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFEP18615 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFEP18615 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NELFEP18615 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NELFEP18615 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NELFEP18615 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NELFEP18615 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NELFEP18615 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NELFEP18615 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NELFEP18615 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NELFEP18615 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NELFEP18615 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NELFEP18615 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NELFEP18615 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NELFEP18615 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NELFEP18615 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NELFEP18615 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NELFEP18615 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NELFEP18615 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NELFEP18615 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NELFEP18615 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NELFEP18615 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NELFEP18615 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NELFEP18615 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NELFEP18615 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NELFEP18615 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NELFEP18615 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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