Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTPS1P17812 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms