Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF3P17036 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF3P17036 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms