Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms