Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC130P13994 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms