Protein–RNA interactions for Protein: P13807

GYS1, Glycogen [starch] synthase, muscle, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS1P13807 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GYS1P13807 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GYS1P13807 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GYS1P13807 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GYS1P13807 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GYS1P13807 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GYS1P13807 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GYS1P13807 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GYS1P13807 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GYS1P13807 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GYS1P13807 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GYS1P13807 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GYS1P13807 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GYS1P13807 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GYS1P13807 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GYS1P13807 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GYS1P13807 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GYS1P13807 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GYS1P13807 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GYS1P13807 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GYS1P13807 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GYS1P13807 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GYS1P13807 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GYS1P13807 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GYS1P13807 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GYS1P13807 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GYS1P13807 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GYS1P13807 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GYS1P13807 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GYS1P13807 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GYS1P13807 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GYS1P13807 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GYS1P13807 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GYS1P13807 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYS1P13807 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYS1P13807 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYS1P13807 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYS1P13807 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYS1P13807 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYS1P13807 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYS1P13807 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYS1P13807 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GYS1P13807 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GYS1P13807 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GYS1P13807 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GYS1P13807 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GYS1P13807 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GYS1P13807 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GYS1P13807 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GYS1P13807 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GYS1P13807 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS1P13807 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS1P13807 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS1P13807 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS1P13807 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS1P13807 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS1P13807 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS1P13807 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS1P13807 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYS1P13807 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GYS1P13807 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
GYS1P13807 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GYS1P13807 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GYS1P13807 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GYS1P13807 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GYS1P13807 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GYS1P13807 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms