Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-EP13747 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms