Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
COL11A1P12107 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL11A1P12107 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms