Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFHP12036 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFHP12036 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFHP12036 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFHP12036 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFHP12036 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFHP12036 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFHP12036 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFHP12036 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFHP12036 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFHP12036 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFHP12036 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFHP12036 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFHP12036 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFHP12036 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFHP12036 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFHP12036 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFHP12036 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFHP12036 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFHP12036 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFHP12036 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEFHP12036 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEFHP12036 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFHP12036 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFHP12036 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFHP12036 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFHP12036 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFHP12036 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFHP12036 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFHP12036 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFHP12036 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFHP12036 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFHP12036 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFHP12036 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFHP12036 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFHP12036 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms