Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCF2P10911 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCF2P10911 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCF2P10911 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCF2P10911 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCF2P10911 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2P10911 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2P10911 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2P10911 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2P10911 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2P10911 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2P10911 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2P10911 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2P10911 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCF2P10911 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCF2P10911 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2P10911 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2P10911 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2P10911 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2P10911 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2P10911 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2P10911 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2P10911 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCF2P10911 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCF2P10911 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCF2P10911 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2P10911 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms