Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf89P0DMQ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms