Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms