Protein–RNA interactions for Protein: P0CB47

UBTFL1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL1P0CB47 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBTFL1P0CB47 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UBTFL1P0CB47 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms