Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP1P09455 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP1P09455 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP1P09455 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP1P09455 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP1P09455 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP1P09455 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP1P09455 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP1P09455 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP1P09455 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP1P09455 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP1P09455 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBP1P09455 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP1P09455 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP1P09455 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP1P09455 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP1P09455 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBP1P09455 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms