Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP10P09238 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP10P09238 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP10P09238 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP10P09238 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP10P09238 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP10P09238 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP10P09238 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP10P09238 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP10P09238 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP10P09238 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP10P09238 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP10P09238 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP10P09238 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP10P09238 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP10P09238 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP10P09238 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP10P09238 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP10P09238 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP10P09238 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP10P09238 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP10P09238 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP10P09238 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP10P09238 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP10P09238 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP10P09238 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP10P09238 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP10P09238 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP10P09238 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MMP10P09238 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP10P09238 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP10P09238 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP10P09238 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP10P09238 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP10P09238 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP10P09238 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP10P09238 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP10P09238 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP10P09238 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP10P09238 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP10P09238 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP10P09238 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP10P09238 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP10P09238 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP10P09238 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP10P09238 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP10P09238 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP10P09238 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP10P09238 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP10P09238 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP10P09238 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP10P09238 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP10P09238 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP10P09238 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP10P09238 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms