Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM2P07951 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM2P07951 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM2P07951 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM2P07951 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM2P07951 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM2P07951 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM2P07951 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM2P07951 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM2P07951 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM2P07951 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM2P07951 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM2P07951 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM2P07951 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM2P07951 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM2P07951 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM2P07951 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM2P07951 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM2P07951 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM2P07951 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms