Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCBP05771 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCBP05771 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCBP05771 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCBP05771 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCBP05771 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms