Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB1P05556 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB1P05556 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms