Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms