Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGAP02671 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGAP02671 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGAP02671 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGAP02671 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGAP02671 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGAP02671 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGAP02671 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGAP02671 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGAP02671 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGAP02671 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGAP02671 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGAP02671 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGAP02671 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGAP02671 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGAP02671 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGAP02671 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGAP02671 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FGAP02671 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGAP02671 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGAP02671 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGAP02671 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGAP02671 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FGAP02671 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FGAP02671 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FGAP02671 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGAP02671 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FGAP02671 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGAP02671 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGAP02671 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGAP02671 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGAP02671 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGAP02671 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGAP02671 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGAP02671 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGAP02671 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGAP02671 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGAP02671 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGAP02671 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGAP02671 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGAP02671 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGAP02671 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGAP02671 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGAP02671 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGAP02671 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGAP02671 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGAP02671 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGAP02671 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGAP02671 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGAP02671 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FGAP02671 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGAP02671 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGAP02671 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGAP02671 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGAP02671 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGAP02671 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGAP02671 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms