Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOEP02649 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
APOEP02649 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOEP02649 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOEP02649 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOEP02649 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOEP02649 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOEP02649 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOEP02649 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOEP02649 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOEP02649 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOEP02649 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOEP02649 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOEP02649 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APOEP02649 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOEP02649 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOEP02649 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOEP02649 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOEP02649 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOEP02649 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOEP02649 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOEP02649 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOEP02649 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOEP02649 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOEP02649 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOEP02649 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOEP02649 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APOEP02649 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOEP02649 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOEP02649 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOEP02649 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOEP02649 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOEP02649 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOEP02649 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOEP02649 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOEP02649 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOEP02649 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOEP02649 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOEP02649 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOEP02649 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOEP02649 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOEP02649 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOEP02649 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOEP02649 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOEP02649 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOEP02649 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms