Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOA1P02647 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOA1P02647 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOA1P02647 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOA1P02647 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOA1P02647 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOA1P02647 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOA1P02647 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOA1P02647 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOA1P02647 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOA1P02647 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOA1P02647 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOA1P02647 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOA1P02647 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOA1P02647 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOA1P02647 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOA1P02647 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOA1P02647 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOA1P02647 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOA1P02647 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOA1P02647 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOA1P02647 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms