Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A1P02462 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A1P02462 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms