Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV1-17P01599 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms