Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINC1P01008 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERPINC1P01008 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms