Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms