Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPO95630 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAMBPO95630 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms