Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms