Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24AO95486 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms