Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms