Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGDSO95455 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGDSO95455 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGDSO95455 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGDSO95455 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGDSO95455 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGDSO95455 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGDSO95455 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TGDSO95455 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGDSO95455 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGDSO95455 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGDSO95455 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGDSO95455 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGDSO95455 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGDSO95455 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGDSO95455 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGDSO95455 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGDSO95455 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGDSO95455 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGDSO95455 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGDSO95455 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGDSO95455 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGDSO95455 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TGDSO95455 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGDSO95455 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGDSO95455 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGDSO95455 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGDSO95455 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGDSO95455 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGDSO95455 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGDSO95455 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGDSO95455 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGDSO95455 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGDSO95455 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGDSO95455 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGDSO95455 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms