Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8BO95263 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8BO95263 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8BO95263 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8BO95263 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8BO95263 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8BO95263 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8BO95263 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8BO95263 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8BO95263 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8BO95263 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8BO95263 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8BO95263 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8BO95263 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8BO95263 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8BO95263 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDE8BO95263 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE8BO95263 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE8BO95263 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms