Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCC1O94876 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms