Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIAO1O76071 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CIAO1O76071 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CIAO1O76071 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CIAO1O76071 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CIAO1O76071 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CIAO1O76071 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CIAO1O76071 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CIAO1O76071 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CIAO1O76071 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CIAO1O76071 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CIAO1O76071 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CIAO1O76071 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CIAO1O76071 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CIAO1O76071 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CIAO1O76071 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CIAO1O76071 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CIAO1O76071 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CIAO1O76071 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CIAO1O76071 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CIAO1O76071 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CIAO1O76071 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CIAO1O76071 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CIAO1O76071 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CIAO1O76071 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CIAO1O76071 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CIAO1O76071 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CIAO1O76071 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CIAO1O76071 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CIAO1O76071 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CIAO1O76071 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CIAO1O76071 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CIAO1O76071 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CIAO1O76071 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CIAO1O76071 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CIAO1O76071 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CIAO1O76071 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CIAO1O76071 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CIAO1O76071 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CIAO1O76071 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CIAO1O76071 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms