Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FLOT1O75955 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms