Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMO75781 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMO75781 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMO75781 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMO75781 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMO75781 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMO75781 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMO75781 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMO75781 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALMO75781 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALMO75781 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMO75781 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMO75781 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMO75781 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMO75781 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMO75781 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMO75781 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMO75781 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALMO75781 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PALMO75781 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PALMO75781 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMO75781 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMO75781 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMO75781 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMO75781 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMO75781 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALMO75781 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMO75781 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMO75781 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMO75781 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMO75781 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALMO75781 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMO75781 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMO75781 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMO75781 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMO75781 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMO75781 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMO75781 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMO75781 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMO75781 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PALMO75781 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PALMO75781 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMO75781 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMO75781 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMO75781 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMO75781 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMO75781 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMO75781 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMO75781 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMO75781 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALMO75781 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMO75781 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMO75781 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMO75781 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMO75781 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMO75781 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMO75781 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMO75781 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMO75781 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALMO75781 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMO75781 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMO75781 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMO75781 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMO75781 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMO75781 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMO75781 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALMO75781 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMO75781 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMO75781 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMO75781 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMO75781 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMO75781 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALMO75781 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms