Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMUO75648 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRMUO75648 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMUO75648 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMUO75648 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMUO75648 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMUO75648 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMUO75648 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRMUO75648 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMUO75648 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMUO75648 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMUO75648 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMUO75648 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMUO75648 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRMUO75648 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRMUO75648 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMUO75648 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMUO75648 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMUO75648 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMUO75648 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMUO75648 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMUO75648 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMUO75648 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMUO75648 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRMUO75648 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMUO75648 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMUO75648 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMUO75648 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMUO75648 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMUO75648 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMUO75648 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMUO75648 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMUO75648 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRMUO75648 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRMUO75648 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRMUO75648 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRMUO75648 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRMUO75648 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRMUO75648 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRMUO75648 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRMUO75648 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms