Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC4O75487 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC4O75487 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC4O75487 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC4O75487 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC4O75487 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC4O75487 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC4O75487 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC4O75487 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC4O75487 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC4O75487 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC4O75487 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC4O75487 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC4O75487 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC4O75487 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC4O75487 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC4O75487 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC4O75487 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC4O75487 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC4O75487 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC4O75487 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC4O75487 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC4O75487 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC4O75487 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC4O75487 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC4O75487 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC4O75487 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC4O75487 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC4O75487 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms