Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS26AO75436 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS26AO75436 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms