Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GADD45BO75293 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45BO75293 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms