Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL41O60662 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms