Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUBNO60494 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUBNO60494 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUBNO60494 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUBNO60494 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUBNO60494 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUBNO60494 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUBNO60494 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUBNO60494 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUBNO60494 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUBNO60494 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUBNO60494 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUBNO60494 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUBNO60494 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUBNO60494 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUBNO60494 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUBNO60494 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUBNO60494 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUBNO60494 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUBNO60494 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUBNO60494 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUBNO60494 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUBNO60494 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUBNO60494 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms