Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNC1O60486 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PLXNC1O60486 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PLXNC1O60486 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PLXNC1O60486 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PLXNC1O60486 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PLXNC1O60486 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PLXNC1O60486 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PLXNC1O60486 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PLXNC1O60486 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PLXNC1O60486 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PLXNC1O60486 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PLXNC1O60486 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PLXNC1O60486 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PLXNC1O60486 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PLXNC1O60486 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PLXNC1O60486 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PLXNC1O60486 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PLXNC1O60486 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PLXNC1O60486 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PLXNC1O60486 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PLXNC1O60486 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PLXNC1O60486 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PLXNC1O60486 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PLXNC1O60486 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PLXNC1O60486 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PLXNC1O60486 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PLXNC1O60486 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PLXNC1O60486 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PLXNC1O60486 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PLXNC1O60486 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PLXNC1O60486 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PLXNC1O60486 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PLXNC1O60486 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PLXNC1O60486 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PLXNC1O60486 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PLXNC1O60486 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PLXNC1O60486 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PLXNC1O60486 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PLXNC1O60486 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms