Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOBOXO60393 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms