Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3O43889 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3O43889 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3O43889 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3O43889 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3O43889 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3O43889 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3O43889 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3O43889 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3O43889 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3O43889 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3O43889 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3O43889 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3O43889 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3O43889 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3O43889 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3O43889 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3O43889 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3O43889 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3O43889 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3O43889 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3O43889 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3O43889 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3O43889 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3O43889 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3O43889 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3O43889 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3O43889 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3O43889 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3O43889 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3O43889 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3O43889 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3O43889 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3O43889 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3O43889 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3O43889 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3O43889 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3O43889 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3O43889 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3O43889 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3O43889 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3O43889 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3O43889 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CREB3O43889 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3O43889 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms