Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms