Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFSF14O43557 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF14O43557 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms