Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ3O43525 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ3O43525 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNQ3O43525 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms