Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBX1O43435 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBX1O43435 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBX1O43435 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBX1O43435 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBX1O43435 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBX1O43435 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBX1O43435 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBX1O43435 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TBX1O43435 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBX1O43435 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBX1O43435 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBX1O43435 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBX1O43435 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBX1O43435 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBX1O43435 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBX1O43435 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TBX1O43435 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBX1O43435 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBX1O43435 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBX1O43435 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TBX1O43435 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBX1O43435 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBX1O43435 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBX1O43435 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBX1O43435 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBX1O43435 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBX1O43435 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBX1O43435 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBX1O43435 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBX1O43435 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBX1O43435 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBX1O43435 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBX1O43435 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TBX1O43435 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBX1O43435 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms