Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COCHO43405 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COCHO43405 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COCHO43405 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COCHO43405 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COCHO43405 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COCHO43405 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COCHO43405 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COCHO43405 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COCHO43405 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COCHO43405 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COCHO43405 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COCHO43405 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COCHO43405 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COCHO43405 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COCHO43405 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COCHO43405 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COCHO43405 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COCHO43405 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COCHO43405 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COCHO43405 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COCHO43405 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COCHO43405 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COCHO43405 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COCHO43405 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COCHO43405 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COCHO43405 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COCHO43405 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COCHO43405 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COCHO43405 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms